关于100万工程款9%的增值税分录，根据业务场景不同可分为以下两种情况：
一、一般纳税人正常纳税情况
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收到工程款时
若为一般纳税人收到100万含税工程款，需先计算不含税金额和销项税额，再做账： $$
\text{不含税金额} = \frac{100万}{1.09} \approx 91.74万
$$
$$
\text{销项税额} = 100万 \times 9% = 9万
$$会计分录为：
$$
\begin{cases}
\text{借：银行存款/应收账款} \ 100万 \
\text{贷：工程结算/预收账款} \ 100万 \
\text{贷：应交税费-应交增值税（销项税额）} \ 9万
\end{cases}
$$ -
支付分包款时
假设支付分包款100万（含税），取得9%专票：
$$
\text{可抵扣进项税额} = 100万 \times 9% = 9万
$$会计分录为：
$$
\begin{cases}
\text{借：合同履约成本-分包成本} \ 87.71万 \
\text{应交税费-应交增值税（进项税额）} \ 9万 \
\text{贷：银行存款} \ 100万
\end{cases}
$$
二、特殊场景（如发票重复开具）
若A公司从甲方拿100万工程，又转包给B公司并开具9%发票，需注意增值税链条的合规性：
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A公司需缴纳 ：
$$
\text{销项税额} = 100万 \times 9% = 9万
$$ -
B公司需缴纳 ：
$$
\text{销项税额} = 100万 \times 9% = 9万
$$ -
A公司可抵扣进项税额 ：
$$
\text{可抵扣进项税额} = 100万 \times 9% = 9万
$$ -
A公司实际应纳税额 ：
$$
9万（销项税） - 9万（进项税） = 0万
$$但需注意发票合规性，避免虚开发票风险。
三、注意事项
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差额计税 ：若符合差额计税条件（如小规模纳税人转包），可降低税负；
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税款抵扣 ：确保进项发票合规，避免因发票问题影响纳税；
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附加税费 ：需计算城建税、教育附加等附加税费。
以上分录需结合具体业务场景调整，建议咨询专业财税人员以确保合规性。
