根据相关税法规定，超过三年是否可以申请个税退税需分情况说明：

一、可申请退税的情形

1. 发现多缴税款

   若纳税人在结算缴纳税款后三年内发现实际缴纳的税款超过应纳税额，可随时向税务机关提出退税申请。

2. 税务机关主动核查

   若税务机关在例行核查中发现多缴税款，也会主动启动退税程序。

二、申请流程与所需材料

1. 在线申请（推荐）

   通过个人所得税APP办理：

   • 进入【办查】→【收入纳税明细年份】→【申报记录】→【退税记录】，核对异常申报记录。

   • 修改专项扣除等错误后，重新提交综合年度汇算。

2. 线下申请

   携带纳税证明、收入证明等材料至当地税务机关提交《契税退税（款）申请审核表》。

三、注意事项

1. 时间限制

   退税申请需在纳税年度终了后三年内提出，超过期限可能无法处理。

2. 特殊情况处理

   • 若涉及银行同期存款利息加算，需提供银行流水等辅助材料。

   • 发现多缴税款后，建议尽早申请，避免影响信用记录或产生滞纳金。

四、补充说明

• 地区差异 ：部分城市可能提供线上一站式服务，具体操作以当地税务局指引为准。

• 争议解决 ：若对税务机关审核结果有异议，可在规定时间内申请行政复议或提起税务诉讼。

建议办理前通过12366官网或APP确认最新政策，确保材料齐全。