关于合作医疗补缴后报销时间的问题，需根据缴费时间、地区政策及缴费档次综合判断，具体分为以下几种情况：

一、补缴后次年1月1日生效（普遍规则）

1. 常规情况

   多数地区规定，合作医疗补缴后需等待至下一年度 1月1日 才能享受报销待遇。例如2025年补缴，则2026年1月1日起生效。

2. 特殊情况

   • 若补缴时间在当年内（如2025年补缴），通常需等待至 次年1月1日 才能报销。

二、补缴后次月或3个月生效（部分地区政策）

1. 断缴时间≤60天

   部分地区允许在停止缴费后 60天内补缴 ，次月即可享受报销待遇。

2. 断缴时间>60天

   • 若补缴时间超过60天但不超过180天，可能需要从缴费当月开始计算， 3个月 后报销。

   • 若补缴时间超过180天，通常需连续缴费满 6个月 才能报销。

三、其他注意事项

1. 跨年补缴

   若在当年下半年补缴下一年的医疗费用，报销待遇通常从 下一年1月1日 开始生效，当年医疗费用需次年报销。

2. 报销流程时间

   补缴后需 1-2个月 完成报销手续（如提交材料、审核等），具体时间因地区而异。

3. 政策差异

   各地政策存在差异，建议补缴前咨询当地医保部门，确认具体生效时间和报销条件。例如：

   • 某地规定补缴后次月可报销；

   • 另一地要求连续缴费满6个月。

四、法律依据

相关法律法规及政策文件（如《社会保险法》）对补缴和报销有明确规范，但具体执行中存在地区性差异，需以当地最新政策为准。

建议办理补缴后，及时联系当地医保机构确认生效时间，并保留好缴费凭证及医疗费用相关材料，以便顺利申请报销。