农村合作医疗与五险中的医疗保险存在以下核心区别：

一、参保对象与覆盖范围

1. 农村合作医疗

   仅限农村户籍居民参加，需通过政府补贴、集体扶持和个人缴费共同筹资，保障范围覆盖门诊、住院等基本医疗服务。

2. 五险（社保）

   覆盖城镇职工及城镇居民，由用人单位和职工共同缴纳，参保后终身享受医疗保险待遇。

二、缴费标准与筹资方式

1. 农村合作医疗

   个人缴费标准较低（每年约200元），政府补贴和集体扶持占主要部分，实行自愿参保、年缴年享。

2. 五险

   缴费标准较高（单位和个人按比例缴纳），以职工工资为基数计算，具有强制性和稳定性。

三、保障待遇与报销政策

1. 农村合作医疗

   • 保障力度有限，报销比例较低，且无个人医保账户，主要覆盖基础医疗保障。

   • 仅能报销门诊、住院等基本费用，重大疾病保障不足。

2. 五险中的医疗保险

   • 报销比例较高，覆盖门诊、住院、重大疾病等多方面，设有个人医保账户，可累计存储资金。

   • 实现“低水平、广覆盖”，不同地区待遇存在差异。

四、保障期限与终身性

1. 农村合作医疗

   为一年期保障，需每年续缴，断缴后需重新参保。

2. 五险中的医疗保险

   参保满15年后终身享受待遇，无需定期缴费。

五、其他险种差异

• 五险 包含养老保险、失业、工伤、生育等综合保障，而农村合作医疗仅限医疗领域。

• 新型农村合作医疗 （已与城镇居民医保合并）已不再单独存在，统称城乡居民医疗保险。

总结建议

若已参加五险，无需再办理农村合作医疗，但需注意两者医疗保险部分不可同时使用。若未参保五险，可根据经济状况选择是否参加新农合或城镇居民医保。建议根据户籍性质和就业情况，结合医疗保障需求综合决策。