农村合作医疗保险报销流程及注意事项如下：

一、报销范围

1. 门诊报销

   参保人员持身份证、医保卡，在区内乡镇级定点医疗机构可直接刷卡报销门诊费用，包括普通门诊、急诊等。

2. 住院报销

   • 本地住院 ：出院时直接刷卡结算；

   • 异地住院 ：需提供转诊证明，出院后30个工作日内提交医疗费用明细、出院小结等材料。

3. 特殊病种门诊报销

   持二级及以上定点医疗机构出具的病历、检查报告及审批表申请，经审核批准后按住院标准报销。

4. 意外伤害住院报销

   需提交意外伤害原因证明及病案记录，经调查审核后报销（第三方责任需另行处理）。

二、报销流程

1. 材料准备

   • 基础材料：身份证、医保卡、医疗费用原始发票、出院小结、门诊病历等；

   • 特殊病种：需额外提供《新型农村合作医疗特殊病种门诊治疗审批表》；

   • 异地就医：需转诊证明。

2. 报销渠道

   • 直接刷卡 ：区内定点医疗机构直接结算；

   • 窗口报销 ：市外住院需30个工作日内提交材料至区新农合窗口；

   • 委托代理 ：需提供代办人身份证及关系证明。

3. 费用核算与兑付

   • 医疗机构初审费用，乡镇级机构复核后，由县级部门统一兑付。

三、报销比例与限制

1. 报销比例

   • 门（急）诊费用：年度累计超过2000元部分按50%报销，个人自付50%；

   • 住院费用：二级及以上医院按30%报销，三级医院按20%报销。

2. 年度限额

   个人每年累计最高报销2万元。

3. 不予报销项目

   • 城镇职工医保覆盖的诊疗项目；

   • 未在医保目录内的药品、服务；

   • 重大疾病门诊等特殊病种需额外审批。

四、注意事项

1. 异地就医备案 ：跨省就医需提前备案，部分地区需办理异地结算；

2. 材料时效性 ：门诊费用需在就诊后12个月内申报，住院费用需出院后30日内；

3. 政策差异 ：具体报销比例可能因地区政策不同存在差异，建议咨询当地医保部门。

以上流程及比例综合了全国通用政策及部分地区规定，具体以参保地最新政策为准。