根据增值税相关规定，销项税率为9%而进项税率为13%时，企业是可以进行抵扣的。以下是具体说明：

一、抵扣原则

1. 可抵扣范围

   只要进项税额属于企业日常经营活动中取得的合法有效凭证（如专用发票、电子专用发票等），无论销项税率如何，均允许抵扣。

2. 抵扣计算方法

   可抵扣进项税额以实际取得额为准，不受销项税率限制。例如：

   • 进项税额13万元，销项税额9万元，则可全额抵扣13万元。

二、特殊场景说明

1. 农产品专用发票

   取得3%农产品专用发票时，可按9%或10%计算抵扣（需符合条件）。

2. 税率匹配问题

   若企业同时涉及不同税率业务（如9%和13%），需分别核算进项和销项，未抵扣完的进项税额可结转下期继续抵扣。

三、注意事项

1. 进项用途限制

   进项税额必须与同期销项税额的业务相关，用于生产经营性活动，个人消费或非应税项目不可抵扣。

2. 申报操作要求

   通过增值税综合服务平台提交抵扣申请，确保发票信息与纳税申报一致。

四、税务风险提示

• 若存在非正常损失（如被盗、霉变等）的进项，需进行进项税额转出处理。

• 保持进项凭证的完整性和合规性，避免因发票问题引发税务风险。

销项9%进项13%的情况完全符合增值税抵扣规则，企业可全额抵扣进项税额。