关于农村合作医疗（新农合）1000元以上的报销比例，根据搜索结果综合如下：

一、住院报销比例（按医院级别划分）

1. 一级医院（乡镇卫生院）

   • 起付线100元，1000元以上部分报销65%

   • 60周岁以上老人每天补偿10元（限额200元）

2. 二级医院

   • 起付线500元，1000元以上部分报销55%

   • 60岁以上老人每天补偿10元（限额200元）

3. 三级医院

   • 起付线1000元，1000元以上部分报销45%

   • 60岁以上老人每天补偿10元（限额200元）

二、门诊报销比例（按医疗机构类型划分）

1. 村卫生室/乡镇卫生院

   • 未设起付线，报销比例通常为60%-80%，部分地区可达70%

   • 慢性病门诊（如高血压、糖尿病）可报销70%

2. 县级及以上医院

   • 未设起付线，报销比例通常为50%-60%

三、其他注意事项

• 检查费、手术费报销限额 ：部分检查项目（如CT、核磁共振）限额200元，手术费超过1000元按1000元报销

• 大病补偿 ：年累计费用超5000元部分可报销65%-70%，特定重大疾病（如肿瘤、尿毒症）补助比例更高

• 地区差异 ：具体比例可能因政策调整而变化，建议咨询当地医保部门

以上信息综合了不同地区的常见政策，实际报销以参保地最新规定为准。