以下是2025年江苏南京治疗肚子疼好的医院：

1. 南京医科大学附属南京医院：这是一家三级甲等综合医院，拥有强大的医疗团队和先进的医疗设备。医院的消化内科在治疗肠炎等胃肠疾病方面具有丰富的经验。

2. 南京市第一医院：这是一所三级甲等综合性医院，其消化科擅长各种胃肠疾病如急慢性肠炎、溃疡性结肠炎等的诊治，在药物治疗与内镜下微创处理等方面均有独到之处。

3. 南京市中医院：这是一家大型中医医院，设有脾胃病科，能为患者提供传统的中医药疗法以治疗肠炎。该医院脾胃病科注重个体化调理，运用中药外敷、针灸推拿等手段来缓解腹痛、腹泻等症状。

4. 南京市鼓楼医院：这是一所历史悠久的三甲综合医院，其消化内科在肠炎的诊断与治疗方面积累了丰富的经验。该医院消化内科采用电子结肠镜检查技术对病变部位进行详细观察，并可根据需要取活检标本送病理检验室进一步分析；同时会针对不同类型的肠炎给予相应治疗方案。

5. 南京市妇幼保健院：这是一所专业性强且设备齐全的妇女儿童专科医院，设有消化内科，可以满足女性患者的就医需求。该医院消化内科重点研究胃十二指肠球部溃疡、慢性胆囊炎等常见消化系统疾病，并熟练掌握各类内镜操作技术；对于肠炎这类特殊病症也能给予正确诊断和适当处理。

6. 东部战区总医院：医院现拥有国家、军队、军区和江苏省重点学科34个。 拥有2名中国工程院院士、1名长江学者、4名百千万人才工程人选。 先后有49人获得政府特殊津贴,17人次获得“何梁何利奖”“国家突出贡献中青年专家”“国家杰出青年基金”等重大奖项。

以上医院均具备较高的医疗水平和完善的服务设施，可以根据自己的实际情况和地理位置选择合适的医院进行就诊。