2025年在上海治疗口腔溃疡反复发作的医院选择较多，以下几家医院在口腔溃疡的诊治方面具有较高的专业水平和良好的口碑：

1. 复旦大学附属华山医院
   华山医院口腔科在全国排名第七，华东地区排名第五，专注于牙齿、牙龈及口腔黏膜疾病的诊治，尤其擅长复发性口腔溃疡的治疗。该医院还提供全面的口腔疾病诊疗服务，包括口腔溃疡的局部治疗和系统治疗。

2. 上海交通大学医学院附属第九人民医院
   该医院口腔黏膜病科在全国排名第三，华东地区排名第十，是治疗口腔溃疡的首选医院之一。其专家团队在口腔溃疡、口腔白斑等疾病方面有丰富的经验。

3. 上海市口腔医院
   上海市口腔医院是一家公立专科口腔医院，拥有先进的医疗设备和专业的医疗团队，专注于口腔溃疡的诊断和治疗。其科室紧跟医学前沿，探索创新治疗方法。

4. 上海长征医院
   长征医院口腔科在全国排名第二十二，华东地区排名第十，其专家团队在口腔溃疡的诊治方面有独到的技术和方法。

5. 上海第九人民医院
   该医院口腔科在口腔溃疡治疗方面具有悠久的历史和特色，专家团队对复发性口腔溃疡的诊治有较高的满意度。

6. 同济大学附属口腔医院
   同济大学附属口腔医院是国内五家拥有国家重点研发计划项目的口腔医院之一，其口腔修复科和口腔正畸科为国家临床重点专科项目，也是治疗口腔溃疡的优选医院。

7. 上海中医药大学附属龙华医院
   龙华医院结合传统中医与现代医学，擅长通过中药外敷或口服来缓解口腔溃疡症状，适合希望尝试中医治疗的患者。

8. 浦东新区花木社区卫生服务中心
   该中心提供复发性口腔溃疡中医特色专病服务，采用中草药和金口石愈疡含漱液等方法治疗，治愈率较高。

9. 上海天佑医院
   天佑医院康复医学科和神经内科在口腔溃疡的综合治疗方面也有一定优势。

根据患者的具体需求（如对中医治疗的偏好、地理位置、经济预算等），可以选择上述医院进行咨询和治疗。建议提前通过电话或在线预约挂号系统进行咨询，并根据医生的专业意见选择适合自己的治疗方案。