退休职工医保二次报销的办理部门及流程如下：

一、办理部门

1. 当地社保局

   退休人员可通过参保地社保局医保服务窗口提交材料办理二次报销。

2. 医院大病结算窗口

   若就诊医院支持全国联网，退休人员可在出院时直接在医院的大病结算窗口使用医保卡报销大病费用。

二、办理流程

1. 材料准备

   需携带以下材料：

   • 新农合补偿结算单/居民身份证原件及参合证（卡）原件；

   • 医疗机构费用发票（加盖公章复印件）及费用清单；

   • 特殊慢性病患者需提供慢性病证或二级以上医疗机构诊断证明；

   • 银行汇款账号（患者本人或关系人）。

2. 提交申请

   • 医院办理 ：在住院期间通过医院大病结算窗口提交材料，完成初次报销；

   • 社保局办理 ：将材料提交至当地社保局医保服务窗口。

3. 审核与报销

   社保部门或医院审核材料后，按比例计算二次报销金额，将补助金额支付至指定银行账户。

三、注意事项

• 地区差异 ：具体办理流程和材料可能因地区政策不同存在差异，建议提前咨询当地社保部门；

• 时间限制 ：部分地区要求在医疗费用发生后一定期限内（如12个月）办理报销；

• 封顶线 ：大病二次报销通常不设封顶线，但需符合医保目录及当地政策规定。

建议退休人员优先确认所在地区具体政策，部分地区可能将部分材料审核前置至医院，以简化流程。