社保减员和医保减员是否需要分开办理，需根据具体情况判断：

一、社保减员与医保减员的关联性

1. 系统操作层面

   社保和医保的减员操作在系统上是独立的，需分别进行。例如，员工离职时需在社保系统提交减员申请，在医保系统单独提交减员手续。

2. 政策规定层面

   根据最新政策，医疗保险已从原社保系统剥离，单位需在社保系统和医保系统分别完成减员流程。

二、不同情况下的处理方式

1. 员工离职减员

   • 社保减员 ：需填写《企业职工社会保险增减表》，提供解除/终止劳动合同证明，通过社保经办机构办理。

   • 医保减员 ：需在医保系统中单独提交减员申请，部分地区需配合提供劳动合同解除证明。

2. 员工调动或合同终止

   若员工因调动或合同终止离职，需在离职当月开始办理社保减员，医保减员需在社保减员完成后单独办理。

三、特殊情况处理

• 同一员工当月减员增员 ：若同一员工在当月办理减员和增员，需确保社保减员已生效且医保减员同步处理，避免出现社保解除但医保仍缴费的情况。

• 系统操作差异 ：不同地区对系统操作要求可能不同，建议提前咨询当地社保部门，部分地区支持线上同步办理。

四、注意事项

• 时间限制 ：社保减员需在离职后15日内办理，医保减员需在社保减员完成后及时办理。

• 材料要求 ：不同系统对材料要求可能不同，建议提前准备《企业职工社会保险增减表》《解除/终止劳动合同证明书》等材料。

社保减员和医保减员通常需要分开办理，具体流程和材料要求需根据当地政策及单位规定执行。