肠道菌群失调症如果不加以治疗，可能会导致一系列不良后果。菌群失调可能引发病情的加重，这是因为有害细菌数量增加，而有益细菌减少，导致了肠道微生态系统的失衡。这种失衡不仅会影响消化系统，还可能导致慢性炎症的发生。慢性炎症是由于炎症细胞在局部长期堆积，最终引起组织的红肿、疼痛等症状，甚至可能伴随发热等全身反应。
肠道菌群失调不及时纠正，容易造成反复发作的情况，患者可能会经历持续性的腹泻、腹痛或者便秘等症状。这些症状如果得不到有效控制，会进一步影响患者的营养吸收能力，导致营养不良，从而削弱身体的整体免疫力和抵抗力。随着免疫力下降，个体更容易受到其他病原体的侵袭，增加了感染的风险，并且可能引发所谓的“二重感染”或“重叠感染”，即在治疗原有疾病的过程中，又发生了新的致病菌感染。
肠道菌群失调还与多种代谢紊乱相关联，如肥胖、糖尿病以及高脂血症等代谢性疾病。这主要是因为肠道菌群参与人体的新陈代谢过程，当菌群失调时，正常的代谢功能受到影响，进而影响到脂肪、糖分等物质的代谢。研究发现肠道菌群失调与心血管疾病、肝脏疾病等多种慢性疾病的发展密切相关，因为它可以促进慢性炎症的发生，增加慢性疾病的发病风险。
除了上述生理上的影响外，肠道菌群失调还可能对心理健康产生负面影响。近年来的研究表明，肠道菌群通过所谓的“肠-脑轴”与大脑之间存在联系，菌群失调可能引起焦虑、抑郁等情绪波动。长期的情绪问题不仅影响个人的生活质量，也可能间接地加剧身体上的不适。
肠道菌群失调如果不进行适当治疗，其潜在的危害是多方面的，不仅限于消化系统的症状，还包括免疫功能下降、慢性炎症、代谢紊乱以及心理健康等方面的问题。一旦出现肠道菌群失调的症状，应及时就医并接受专业的诊断和治疗，以防止上述并发症的发生和发展。
为了恢复肠道菌群的平衡，通常需要采取综合性的治疗方法，包括但不限于调整饮食习惯、补充益生菌、合理使用抗生素以及必要时采用药物治疗。通过这些措施，可以帮助恢复肠道内有益菌的数量和活性，从而改善整体健康状况。
