森林脑炎的典型症状如下：
- 发热：一般起病 2-3 天发热达高峰，体温可达 39.5-41℃，大多数患者持续 5-10 天后呈阶梯状下降，经 2-3 天下降至正常。热型多为稽留热，部分患者可出现弛张热、双峰热或不规则热。
- 全身中毒症状：高热时伴头痛、全身肌肉痛、无力、食欲缺乏、恶心、呕吐等。由于血管运动中枢的损害，患者还可出现面部、颈部潮红，结膜充血，脉搏缓慢。部分重症患者有心肌炎表现，常有心音低钝，心率增快，心电图检查有 T 波改变，严重患者可突然出现心功能不全、急性肺水肿等。
- 神经系统症状
- 脑膜刺激征：是该病最早出现和最常见的体征，一般可持续 5-10 日，意识清楚后仍可存在，表现为颈项强直、克氏征和布氏征阳性。
- 意识障碍：半数以上患者有不同程度的意识障碍，表现为嗜睡、谵妄、昏睡、乃至深度昏迷状态，也可表现为狂躁不安、惊厥和神经错乱等，意识障碍随体温下降而逐渐恢复。
- 瘫痪：多发生在颈部、肩胛肌和上肢肌肉，其次为偏瘫和下肢瘫痪，脑神经瘫痪不多见。多呈弛缓型，常出现于发病第 2-5 日，发生在颈部或肩胛肌时出现特有的头部下垂症状。瘫痪一般经 2-3 周后逐渐恢复，约半数出现肌肉萎缩。部分患者还会出现锥体外系统受损征，如震颤、不自主运动等，偶尔可见语言障碍、吞咽困难等延髓麻痹症状，或中枢性面神经和舌下神经的轻瘫。
部分患者可能会出现皮疹，多为出血性皮疹。还有些患者可能会出现认知语言障碍、共济失调、头痛、听力丧失等后遗症。
