常熟由苏州市代管的历史背景和现实原因可归纳如下：

一、历史沿革因素

1. 古代行政归属

   常熟历史可追溯至春秋战国时期，长期属于吴、越、楚等诸侯国管辖。秦朝设郡县后，其地属会稽郡吴县，后历经多次行政区划调整，至西晋太康四年（283年）设立海虞县，成为常熟建制的开端。

2. 近代行政区划调整

   清朝时期，苏南地区曾属常州府管辖，常熟为其中之一。1996年江苏省进行地市调整时，原属扬州市的泰州市（含姜堰、泰兴等县）升格为地级市，常熟作为原泰州市的一部分被划归苏州市代管。

二、现实行政区划调整

1. 1996年地市调整背景

   当时江苏省推动县级市向地级市转型，常熟因经济基础较好、综合竞争力突出，成为苏州代管县级市的理想选择。

2. 地理与行政关联

   常熟与苏州主城区地理相近，东邻太仓、昆山市，南接苏州市相城区，西连无锡市锡山区，西北与张家港市接壤。这种地理接近性为行政整合提供了便利条件。

三、当前政策与发展趋势

1. 一体化发展目标

   近年来，苏州市明确将常熟作为重点发展对象，提出“城市重点向南”的战略，推动常熟与苏州主城实现无缝对接，进一步强化了代管关系。

2. 行政区划调整可能性

   部分分析认为，随着常熟经济持续增长和基础设施完善，未来有可能与昆山、太仓合并，形成超大城市，但这一过程需综合考虑多方面因素。

综上，常熟由苏州市代管是历史演变与行政区划调整共同作用的结果，未来是否进一步整合仍需视政策与实际情况而定。