小儿真菌性肺炎的治疗通常包括以下几个主要方面：
抗真菌药物治疗
抗真菌药物是治疗小儿真菌性肺炎的主要药物，根据不同的真菌类型和感染的严重程度，选择合适的抗真菌药物。
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两性霉素B（AmB）：为广谱第一线抗真菌药物，口服不能吸收，必须由静脉滴入。初为每天0.1mg/kg逐天增加0.1mg/kg，直至每天或隔天1mg/kg，疗程6～12周。对于肺毛霉菌病及肺曲菌病剂量可达1.5mg/kg。
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两性霉素B脂质体：用于无法耐受传统两性霉素B制剂的患者、肾功能严重损害、不能使用传统两性霉素B制剂的患者。起始剂量为每天1mg/kg，经验治疗的推荐剂量为每天3mg/kg，确诊治疗为每天3或5mg/kg，静脉输注的时间不应少于1h。
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氟胞嘧啶（5Fc）：对念珠菌、隐球菌及曲菌的少数菌株有效。疗效比两性霉素差，临床常二者联合应用。本品易产生耐药性，口服吸收良好，剂量为每天50～150mg/kg，每6小时给药1次，疗程为1～3个月。
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克霉唑：对念珠菌、隐球菌、曲菌及荚膜组织胞浆菌均有良好的抑菌作用，不易产生耐药性，口服吸收快，剂量为每天50～100mg/kg，每8小时1次。
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伏立康唑：具有广谱抗真菌作用，尤其是对侵袭性曲霉菌有效。
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酮康唑：对念珠菌、新型隐球菌、荚膜组织胞浆菌、球孢子菌有抗菌作用。口服吸收好，毒性小，疗效好，不损害肾功能，与AmB合用能增加杀菌能力。本药不能通过血脑屏障。
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伊曲康唑：用于曲霉菌、念珠菌属、隐球菌属和组织胞浆菌等感染的预防治疗。
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氟康唑：用于非粒细胞减少患者的深部念珠菌病。
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卡泊芬净：用于侵袭性念珠菌病、念珠菌血症及侵袭性曲霉菌病。
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球红霉素：疗效类似AmB，但毒性较AmB低。口服不能吸收，必须由静脉滴注。
辅助治疗
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治疗原发病：积极治疗可能存在的基础疾病，增强机体免疫功能。
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增加营养：适量给予多种维生素，保持充足的休息和均衡饮食。
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免疫调节治疗：对于存在免疫缺陷的小儿真菌性肺炎患者，可使用免疫增强剂等。
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肺功能锻炼：在专业指导下进行规律性的深呼吸、咳嗽练习等活动，以增强呼吸肌肉力量和增加肺活量。
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中药调理：可根据患儿体质虚弱、久病后气血不足、痰湿内蕴等情况，使用中药进行调理。
手术治疗
对于肺空洞型曲菌球病且有反复咯血者，可行外科手术切除。手术方式以肺叶切除术为宜，尽量避免全肺切除术。
其他治疗
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全身支持治疗：包括人免疫球蛋白和血浆的应用，以增强机体免疫力。
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防止合并症：在治疗原发真菌感染的要注意预防细菌和病毒感染。
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停用激素和免疫抑制剂：真菌性肺炎的发生与激素和免疫抑制剂的使用有关，因此需及时停药。
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加强营养支持：真菌性肺炎对孩子的消耗很大，治疗过程中需要加强营养支持。
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保持水电平衡：多饮水，适当补充电解质，以维持水电平衡。
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输新鲜血液：必要时可输新鲜血液，以提高机体免疫力。
治疗小儿真菌性肺炎需要综合多方面的措施，家长和医生需要密切合作，才能确保患儿尽快康复。在治疗过程中，应密切监测患儿的症状变化及药物反应，定期复查胸部X线检查或高分辨率CT扫描，以评估治疗效果和调整方案。
