医保卡被法院冻结的合法性需要根据具体情况判断，主要分为以下情形：

一、一般情况下医保卡不得冻结

根据相关法律规定，医保卡属于社会保险基金代扣代缴的账户，其资金属于专项基金，用于保障参保人员的基本医疗需求，不得被查封、扣押或冻结。具体法律依据包括：

1. 《中华人民共和国民事诉讼法》 ：规定不得查封、扣押、冻结被执行人及其所扶养家属生活必需的物品及生活费用；

2. 《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》 ：明确将医保卡列为不得查封、扣押、冻结的财产。

二、特殊情况下可能被冻结

在以下特殊情形下，法院可能对医保卡采取临时冻结措施：

1. 涉及重大债务纠纷且影响基本生活 ：若被执行人因重大债务纠纷被执行，且法院认为冻结医保卡是保障债权人权益的必要措施；

2. 医保账户内存在可执行财产 ：如医保卡金融账户中存有现金，法院可依法冻结。

三、冻结后的救济途径

1. 申请解除冻结 ：被执行人可以向法院申请解除对医保卡的冻结，或申请部分解除；

2. 提供替代财产 ：法院可能要求被执行人提供其他可供执行的财产；

3. 诉讼救济 ：通过诉讼程序对执行措施提出异议。

四、注意事项

• 避免违法操作 ：医保卡冻结需依法进行，个人不得擅自申请冻结他人医保卡；

• 合规使用 ：避免因欠费、违规行为导致医保待遇中断，以免影响其他权益。

综上，医保卡在一般情况下不得被冻结，但特殊情况下法院可依法采取临时措施。若遭遇此类情况，建议通过法律途径维护自身权益。