根据搜索材料和相关法律法规，对于逾期自行补申报是否都要处罚的问题，具体情况需要根据不同税种和具体情况进行分析。以下是详细解答：
1. 增值税零申报逾期补申报
对于增值税零申报逾期未申报的情况，纳税人需要及时补报以避免处罚和滞纳金的产生。根据《人民税收征收管理法》第三十二条的规定，纳税人逾期未申报税款，税务机关可责令其补报并依照实际情况酌情处以滞纳金
2. 个人所得税补申报
对于个人所得税的补申报，如果纳税人在检查期间自行补缴了税款，并且多补缴了税款，仍然少缴的税款占多补缴的税款比例较小（例如1.8%），根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十三条第一款规定，可以不予行政处罚。但如果纳税人未按时申报且少缴税款较多，可能会面临罚款，具体罚款金额根据少缴税款的数额和情节严重程度而定。
3. 其他税种的补申报
对于其他税种的补申报，例如企业所得税、房产税、城镇土地使用税等，如果纳税人在检查期间自行补缴了税款，并且多补缴了税款，仍然少缴的税款占多补缴的税款比例较小，通常可以不予行政处罚。但如果纳税人未按时申报且少缴税款较多，可能会面临罚款。
4. 个体户的逾期申报
对于个体户的逾期申报，如果是个体户在年度内第二次未能在规定时间内提交纳税申报表和相关资料，税务机关可以处二千元以下的罚款
5. “首违不罚”政策
根据“首违不罚”政策，如果纳税人在限改期内完成补申报，并且是当年内首次违法，可以享受不予行政处罚的待遇
总结
逾期自行补申报是否都要处罚，取决于以下因素：
- 1.补申报的时间：如果在限改期内及时补申报，可以减轻或免除处罚。
- 2.补缴税款的金额和比例：如果少缴税款占多补缴税款的比例较小，可以不予行政处罚。
- 3.是否首次违法：如果是当年内首次违法，可以享受“首违不罚”政策。
- 4.税种和具体情况：不同税种和具体情况可能会有不同的处理方式。
建议纳税人及时补申报并缴纳相应的滞纳金或罚款，以避免更严重的法律后果。如果有疑问，可以咨询专业税务顾问或税务机关。
