增值税申报表附表二填报规则如下：

一、基础信息栏

1. 税款所属时间 ：填写申报的增值税应纳税额所属时间，需精确到年、月。

2. 填表日期 ：填写申报当天的日期。

3. 纳税人名称 ：需加盖单位公章。

二、申报抵扣进项税额部分

1. 第1至12栏 ：反映本期申报抵扣的进项税额，需按认证类型和抵扣状态区分：

   • 第1栏 ：认证相符的增值税专用发票（含红字发票），需等于第2栏（本期认证且申报抵扣）与第3栏（前期认证且申报抵扣）之和。

   • 第2栏 ：本期认证相符且申报抵扣的发票金额。

   • 第3栏 ：前期认证相符且申报抵扣的发票金额。

   • 其他类型发票 （如通行费电子发票）需单独填列在对应类型栏次。

2. 特殊发票处理 ：

   • 非防伪税控发票填入第4至10栏，需与第5至8栏（其他扣税凭证）之和相等。

   • 海关进口增值税专用缴款书需在“其他扣税凭证”栏单独填报。

三、进项税额转出部分

1. 第13至21栏 ：反映已抵扣但需转出的进项税额，包括非应税项目、集体福利、个人消费用等。

2. 第14至21栏 ：需分别填写不得抵扣的进项税额明细。

四、其他注意事项

1. 金额填写规范 ：所有金额需为含税金额，报表金额与账簿金额需一致（如运费需扣除7%税额）。

2. 辅助期纳税人 ：需根据税务机关核定的比对结果填写第25、26栏（未申报抵扣及不允许抵扣的发票）。

3. 附表关联 ：需同时附列《发票领用存月报表》《增值税专用发票使用明细表》等。

五、审核要点

• 第3栏 ：本期认证抵扣发票份数、金额、税额需≤稽核比对相符发票数据。

• 第8栏 ：运输费用结算单据金额需≤交叉稽核或协查后允许抵扣的运输费用。

• 异常处理 ：若报表数据大于稽核结果，需按“一窗式”比对异常流程处理。

以上规则综合了增值税纳税申报表附表二的填写规范，需确保数据准确性和完整性。