当您在12306网站或应用程序上购票时遇到支付成功但未能出票的情况，您可以采取以下步骤来处理这个问题：

不要惊慌。这种情况可能由多种原因引起，包括系统调试、订单处理失败、系统故障或者网络问题等。首先要做的是登录您的12306账户，进入“我的订单”页面查看订单状态。如果订单显示为“已支付”，则说明票已经成功预订；如果显示为“未支付”或其他状态，则需要进一步处理。

如果发现钱被扣了但是票没有出，可以拨打12306客服电话，并提供您的订单号和身份证号码等信息，客服人员将帮助您查询订单状态并处理相关问题。您也可以尝试重新进入系统并刷新订单信息，确保获取最新的订单状态。

有时候，由于网络拥堵或是系统响应过慢，可能会导致短暂的延迟。在这种情况下，建议等待一段时间（通常几分钟到几个小时不等），然后再次检查订单状态。若长时间仍未解决问题，可以考虑前往车站窗口咨询和处理，带着身份证和支付凭证，工作人员会帮您查明原因，并尽快给出答复。

如果您使用的是第三方购票软件，如360抢票王或猎豹等，可能需要先取消掉之前出票失败的订单，才能重新购票。这是因为第三方软件可能会有缓存或者同步问题，导致订单状态更新不及时。

在某些特殊情况下，比如重复支付，即用户在第一次支付后未收到确认信息而进行了第二次支付，这可能导致同一订单被多次扣款。针对这种情况，12306官方表示会在清算时识别重复支付的问题，并按照规定流程进行退款处理。

值得注意的是，退款过程可能不会立即完成，尤其是在银行处理时间较长的情况下。根据人民银行的相关规定，如果车票没订上，钱被扣了，银行会在15个工作日内把款项退回到您的账户上。因此，请耐心等待，并保持与银行客服的沟通以了解具体的退款进度。

面对12306付款成功但未出票的问题，最重要的是保持冷静，通过正规渠道寻求解决方案，无论是联系客服还是亲自前往车站窗口解决，都应确保个人信息的安全性，避免因急于解决问题而遭受不必要的经济损失。同时，建议在未来的购票过程中，提前检查好网络环境和个人信息，尽量避免类似情况的发生。