医保个人账户支付的费用扣除方式如下：

一、支付来源

医保个人账户的资金来源包括：

1. 个人缴费 ：职工医保个人账户由个人缴纳的基本医疗保险费按比例划入（通常为缴费基数的2%）；

2. 单位缴费 ：单位缴纳的基本医疗保险费中的一部分（约30%-35%）也会划入个人账户。

二、支付场景与扣款方式

1. 门诊、药店消费

   在定点医疗机构门诊就诊或定点零售药店购买药品、医疗器械等符合规定的个人自费项目时，直接从个人账户余额中扣除。

2. 异地就医

   参保人在异地联网结算的定点机构就医时，个人账户资金可按当地规定直接用于支付。

3. 特殊门诊/住院报销后自费部分

   对于乙类药品、丙类药品等需先通过统筹账户报销的费用，报销后剩余的自费部分可从个人账户直接刷卡支付。

三、注意事项

• 账户类型差异 ：医保卡通常分为个人账户和统筹账户，个人账户为个人专用，统筹账户为集体账户，两者资金不可混用；

• 支付限制 ：个人账户资金不得用于公共卫生费用、体育健身等非医保保障范围支出；

• 查询方式 ：可通过医保官方渠道（如“陕西医保”小程序）查询每月划入金额。

综上，医保个人账户支付主要扣减个人账户内的余额，但具体使用规则因费用类型和地区政策有所差异，建议通过官方渠道确认最新政策。