农村合作医疗在杭州可以报销。以下是具体的报销情况：

1. 门诊报销：

   • 普通门诊方面，乡镇级医疗机构（如村卫生室、社区卫生服务中心等）的报销比例通常较高，部分地区可达70%左右；一级定点医疗机构（含村卫生室）门诊报销比例也有80%；而村卫生室及村中心卫生室的就诊处方药费限额为10元，卫生院医生临时补液处方药费限额为50元。
   • 两病门诊（高血压、糖尿病等慢性病）使用“两病”用药目录中乙类药品的，个人需先自付10%，剩余部分按法规的报销比例进行报销。
   • 慢性特殊病种门诊报销时不设起付线，在相应病种年度报销限额内，按新规范围内费用的70%（乙类项目先自付10%后）进行报销。

2. 住院报销：

   • 乡（镇）卫生院的报销比例一般为30%的费用报销30%，200元以上的费用报销70%；县级定点医疗机构则是500元以下的费用报销25%，1000元以上的费用报销75%。
   • 二级医院报销比例为30%的费用报销30%，1000元以上的费用报销75%；三级医院则是500元以下的费用报销20%，2000元以上的费用报销75%。
   • 一个结算年度内，发生符合报销范围的10万元以下的医疗费，三级医疗机构起付线为800元，二级医疗机构起付线为500元，一级医疗机构起付线为300元。

3. 大病保险报销：

   • 起付线以上的费用按一定比例支付，最高限额可达一定金额（如25万元，部分地区可能更高）。

总的来说，农村合作医疗在杭州可以报销，但具体报销比例和额度因医疗机构级别、医疗费用范围以及是否达到起付线等因素而异。建议在就医前详细了解当地的医保政策，以便更好地享受医保待遇。