医保余额通过手机应用程序（如国家医保服务平台App）进行转移后，具体的生效时间取决于多个因素，包括转出地和转入地的处理速度、地区政策差异等。通常情况下，整个转移流程可能需要15-30个工作日来完成，但实际到账时间可能会有所不同。
在成功发起医保关系转移申请之后，转出地经办机构一般会在10个工作日内完成基本医疗保险关系的转出，并生成、上传《参保人员基本医疗保险信息表》，同时划转职工医保个人账户余额。一旦转出地完成了这些步骤，转入地经办机构应在收到相关信息后的5个工作日内将《参保人员基本医疗保险信息表》同步至本地医保信息平台，完成转入，并接收职工医保个人账户金额。
由于涉及到数据推送、银行间资金划转等因素，个人账户余额的实际到账时间可能会比上述流程所需的时间更长。根据一些资料，个人账户余额到账时间晚于缴费年限记录转入，通常大约为15个工作日。但是，在某些情况下，比如涉及市级医疗保险、省级医疗保险以及银行间的协调工作时，这个过程可能需要长达三个月左右的时间才能完成。
值得注意的是，不同地区的具体操作流程和时间安排可能存在差异。例如，在南京，医保个人账户余额预计在转出后的30个工作日左右会转账到市民卡关联的银行账户中，前提是该市民卡的金融功能已被激活。而在其他地方，如鄂尔多斯市，转入地经办机构在收到转出地划转的个人账户余额后，核对无误后可在10个工作日内将个人账户金额计入参保人员的个人账户。
因此，为了获得最准确的信息，建议直接咨询当地的社会保障或医疗保险经办机构。使用国家医保服务平台App或其他官方渠道进行查询可以帮助您跟踪转移进度，并了解您的个人账户余额何时能够正式在新地点使用。如果在规定的期限内未见到余额到账，应该及时联系相关部门解决潜在的问题。
