南京口腔科最好的医院排名如下：

1. 南京医科大学附属口腔医院：是江苏省*三级甲等口腔医院，江苏省口腔卫生指导中心单位。现为中华口腔医学会副会长单位，江苏省口腔医学会会长，江苏省医师协会口腔分会主任委员单位。

2. 江苏省人民医院口腔科：科室的整体项目和数据规模均处于本地综合医院口腔科的前列。科室有医护人员30人，其中硕士导师3人，主任医师4人，副主任医师5人，主治医师6人，其中博士3人，硕士7人。

3. 江苏省中医院口腔科：80年代末期，经过多年的发展，他负责口腔疾病的门诊诊断、治疗和预防，同时不断提高专业水平，引进世界上的良好技术和新种类，形成了以修复方式和种植为主的修复治疗技术。

4. 南京口腔内科：华东有影响力的特色之一。目前硕士导师3人，主任医师5人，副主任医师15人。牙体牙髓学、口腔黏膜病、牙周病、儿童牙病等特色门诊二级科室。

5. 南京市第一医院口腔科：门诊设在南院和东院。年门诊量40多万人次，在全市综合医院口腔科中名列前茅。

以上排名不分先后，这些医院都是南京地区口腔科领域的佼佼者，拥有先进的设备和专业的医疗团队，能够提供高质量的口腔医疗服务。如果您有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。