在湖南娄底，治疗肩膀疼痛伴头痛的医院主要有以下几家：

1. 1.娄底市第一人民医院：科室：骨关节外科肩肘运动医学团队、肩痛门诊。特色：设有专门的肩痛门诊，擅长治疗肩周炎、肩峰滑囊炎、肱二头肌长头肌腱炎、冈上肌腱炎、肩峰撞击综合征等慢性软组织损伤，以及肩袖肌腱损伤、肩盂及盂唇软骨损伤、骨折脱位等。专家：梁振扬副主任医师和刘至专主治医师。
2. 2.娄底市中医医院：科室：九病室针灸科（颈肩疾病专区）。特色：运用小针刀配合龙氏治脊疗法治疗软组织疼痛、颈肩背部疼痛、脊柱相关疾病等。专家：陈书佩主治医师，擅长运用小针刀、龙氏整脊手法、针灸等治疗脊柱相关疾病和软组织疼痛。
3. 3.娄底市中心医院：科室：骨科特色：在骨科创伤、骨病、脊柱及关节外科的诊治方面有丰富的经验专家：康列和主任医师、彭阳副主任医师等
4. 4.娄底市第二人民医院：科室：骨科特色：擅长颈椎病、腰椎病以及慢性痛的诊断及治疗专家：陈有盛主治医师等
5. 5.双峰县人民医院：科室：骨科特色：擅长各种骨伤骨病的诊治专家：胡德义副主任医师、杜长安副主任医师等

这些医院在治疗肩膀疼痛和头痛方面都有丰富的经验和专业的团队，可以根据具体情况进行选择。如果需要更详细的咨询或预约，可以访问医院的官方网站或拨打医院的热线电话。