合作医疗在外地住院的报销比例和流程如下：

报销流程

1. 1.开具转诊证明：首先需要在住院医院找到副主任以上级别的医师，帮忙开具转诊证明，并加盖医院的公章
2. 2.办理跨省就医手续：拿着转诊证明去当地的社保局或医保管理部门办理跨省就医手续，并明确标注跨省就医的城市和医院名称
3. 3.垫付医疗费用：在异地定点医院就诊治疗的费用需要先由参保人垫付
4. 4.报销医疗费用：出院时可以直接在医院进行医疗费用报销，报销原则是多退少补。如果所在地区不支持异地结算，则需要携带相关资料返回参保地进行报销

报销比例

1.门诊报销比例： 村诊所：60% 乡镇卫生院：40% 二级医院：30% 三级医院：20%

2.住院报销比例： 乡镇卫生院：60% 二级医院：40% 三级医院：30%

3.大病报销比例： 门诊统筹村级医院：75% 乡级医院：65% 二级医院：75%-85% 三级医院：55%-60% 省三级医院：55% 特定疾病（如儿童先心病、肺癌等）：70%

注意事项

• 并非所有医疗项目都按上述比例报销，具体报销比例还需参照当地的报销标准
• 异地就医报销比例通常会略低于本地就医，具体差异需根据不同地区的方案和法规来确定

举例

例如，在上海市奉贤区中心医院住院治疗的患者，如果办理了转诊手续并符合异地就医条件，住院报销比例可能为40%（二级医院）

希望以上信息对您有所帮助。如有更多疑问，建议咨询当地社保局或医保管理部门。