总价包干合同工程量减少的结算方式需根据合同条款和实际情况综合判断，具体处理方式如下：

一、工程量减少的常规处理原则

1. 甲方要求变更导致减少

   若工程量减少是甲方（发包方）因设计变更、功能调整等要求导致的，结算时需直接扣除减少工程量对应的合同价款。

2. 非甲方原因导致减少

   • 若减少因施工方统计错误或设计图纸未变化引起，且合同未约定此类情况的处理方式，则合同价通常不予调整。

   • 若减少量超过合同约定优惠比例（如影响大量优惠条款），承包方可与甲方协商补偿材料费用或调整合同价。

二、特殊情况下的补充措施

1. 固定总价合同的严格限制

   固定总价合同仅允许在合同范围、设计、要求不变的前提下调整总价。若实际工程量减少但设计未变，承包方可主张按实际成本结算，但需提供充分证据。

2. 损失补偿机制

   若工程量减少导致承包方投入成本增加（如设备租赁、材料浪费等），承包方需提供详细损失清单，与甲方协商补偿。

3. 合同条款的明确约定

   • 建议合同中明确工程量减少的计价方式（如综合单价、固定单价等）及调整条件，避免因条款模糊引发争议。

   • 对于可能影响合同价的关键变更，应通过书面协议（如补充合同、联系单）确认双方意愿。

三、争议解决途径

• 协商调整 ：双方优先通过友好协商达成一致。

• 仲裁或诉讼 ：若协商失败，可依据合同仲裁条款或诉讼途径解决争议。

四、注意事项

• 总价包干合同对发包方有利，承包方需注意合同细节，避免因工程量波动导致亏损。

• 实际结算时，应结合工程变更审批流程、市场价格波动等因素综合评估。

综上，工程量减少的结算需以合同约定为核心，结合实际情况灵活处理，同时加强合同管理以降低风险。