根据现有信息,农业部在新疆的央企是 中国农业发展集团有限公司(中国农发集团) 。该企业成立于2004年,是国务院国资委直接管理的大型综合性中央农业企业,总部位于北京。其业务范围覆盖农业全产业链,包括种业、渔业、畜牧业及农业服务业等领域,在新疆等地设有分支机构或项目,负责农业综合开发、农村金融服务等职能。
需要说明的是,虽然中国农发集团与原农业部有历史关联(前身为原农业部所属的中国水产(集团)总公司、中国牧工商(集团)总公司等),但两者是不同性质的企业。目前农业部的直接管理企业中,除中国农发集团外,还有中国国家铁路集团、中国邮政集团等,但它们与新疆的关联度较低。