根据2025年新疆昌吉医保政策，住院报销比例因医院级别不同而有所差异，具体如下：
1. 住院报销比例
- 乡镇卫生院（社区卫生服务中心）：报销比例为 90%。
- 其他一级医院：报销比例为 85%。
- 二级医院：报销比例为 80%。
- 三级医院：报销比例为 65%。
- 转往自治州外、自治区内定点医院：报销比例为 50%。
- 转往疆外定点医院：报销比例为 45%。
2. 特殊情况下的报销比例
- 未办理转诊转院手续或不符合急诊条件赴外住院：在原报销比例基础上降低 30%。
3. 大病保险待遇
- 对于住院费用较高的情况，昌吉医保设有大病保险分段补偿机制：
- 5001-10000元：补偿比例为 65%。
- 10001-18000元：补偿比例为 70%。
4. 其他相关待遇
- 门诊特殊慢性病：一类慢性病（如糖尿病、高血压等）门诊就医报销比例为 60%，年度限额为 2000元。
- 两病门诊用药（高血压、糖尿病）：自2025年2月1日起，报销比例调整为 70%（基层定点医疗机构），年度最高支付限额分别为 200元（高血压）和 300元（糖尿病）。
5. 政策依据
上述信息来源于昌吉医保局发布的相关政策文件。
如需进一步了解，可访问昌吉医保局官方网站或拨打当地医保服务热线咨询。
