医保备案省本级和市本级的区别主要体现在以下几个方面：
- 主管机构不同 ：
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省级医保的主管单位是省医疗保障局下属的省医保中心。
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市级医保的主管单位是各个城市的医疗保障局下属的市医保中心和县医保中心。
- 参保对象不同 ：
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省级医保的主要参保对象是省直单位，如省级机关、省属事业单位、中央派驻省级的办事机构和事业单位、省属企业和央企派驻省级的分支机构，在省市场监管部门登记注册的企业等。
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市级医保的参保对象是市级行政区域内的机关事业单位、企业职工和灵活就业人员等。
- 医保制度的规定有区别 ：
- 由于我国的医疗保险是按照地市级行政单位统筹的，省级医保和市医保属于不同的统筹区，因此医保实施细则的规定存在很多细微的差别，比如医保的个人账户返还比例、医保住院的报销比例等。
- 社保卡有差别 ：
- 省级医保使用的社保卡是由省级人社部门发放的，市级医保使用的社保卡是由市级人社部门发放的，上面的公章分别为某某省人力资源社会保障厅或某某市人力资源社会保障局。
- 缴费基数和资金流向不同 ：
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省级医保的缴费基数是以全省上年职工平均月薪为基数折算计算，市级医保是以当地市为基数。
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省级医保的钱最终流向省级管理的基金，市级医保的钱最终流向市级社保。
- 适用范围和统筹范围不同 ：
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省级医保适用范围更广，全省通用，而市级医保只能在当市可用。
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省级医保的统筹范围是以全省为范围，而市级医保的统筹范围是以全市为范围。
- 就医和住院用药及检查项目不同 ：
- 省级医保就医和住院时用药数量和检查项目都比市级医保多。
- 报销比例不同 ：
- 一般情况下，省医保的报销比例高于市医保。
- 定点医药机构不同 ：
- 省级医保的定点医药机构包括全省范围内的省卫生厅管理的定点医院，而市级医保的定点医药机构则包括市级卫生局管理的定点医院。
- 其他办理事项不同 ：
- 省级医保只能是省直单位的职工和档案在省人才代理中心保管且办有省养老统筹的办理，而市医保只能是市直单位的职工和档案在市人才代理中心保管且办有市养老统筹的办理。
综上所述，省本级和市本级医保在主管机构、参保对象、医保制度规定、社保卡、缴费基数和资金流向、适用范围和统筹范围、就医和住院用药及检查项目、报销比例、定点医药机构以及其他办理事项等方面都存在明显的区别。建议根据个人的工作单位性质和所在地的具体规定，选择合适的医保备案类型。
