灵活就业人员参加职工医保后，个人账户是否会有余额，需根据缴费档次和参保类型综合判断，具体说明如下：

一、灵活就业人员医保个人账户的设立与资金来源

1. 账户设立

灵活就业人员参保职工医保时，个人账户与职工医保一致，由单位缴费的2%和本人缴费的8%共同划入。

2. 资金划入规则

• 缴费基数4.2%档 ：个人账户按缴费基数的4.2%划入，每月有固定金额进入账户。

• 缴费基数8%档 ：部分地区（如湖南）自2023年起取消个人账户，个人缴费8%全部进入统筹账户，账户无余额。

二、账户余额的实际情况

1. 有余额的情况

• 选择4.2%缴费档的灵活就业人员，每月可获个人账户返现，账户中有钱可用于门诊、药店购药或住院报销。

• 退休人员（部分地区）每月定额划入固定金额，账户持续有资金补充。

2. 无余额的情况

• 选择1档缴费标准的灵活就业人员，个人账户不返钱，账户保持零余额，但医保待遇不受影响。

三、注意事项

• 城乡居民医保 ：无个人账户，缴费全部进入统筹账户，医保卡无余额。

• 地区政策差异 ：灵活就业医保的缴费档次和账户规则可能因地区而异，建议咨询当地社保部门确认。

综上，灵活就业医保个人账户是否有余额，主要取决于缴费档次。建议参保人根据经济状况选择合适档次，并关注当地医保政策调整。