重庆农村医保分为一档和二档，它们之间存在以下主要区别：
- 缴费标准 ：
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一档：320元/人·年。
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二档：695元/人·年。
- 住院报销比例 ：
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一档：
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在实施基本药物制度的一级医院住院费用按80%支付（基本药物按90%支付），未实施基本药物制度的医院住院费用按60%支付，二级医院按58%支付，三级医院按45%支付。
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二档：
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在实施基本药物制度的一级医院住院费用按85%支付（基本药物按90%支付），未实施基本药物制度的医院住院费用按70%支付，二级医院按70%支付，三级医院按60%支付。
- 普通门诊报销 ：
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一档：
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社区卫生服务中心（含乡镇卫生院）报销比例60%，限额200元；一级医院报销比例60%，限额300元；二级医疗机构报销比例40%，限额400元；三级医疗机构报销比例40%，限额500元。
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二档：
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社区卫生服务中心（含乡镇卫生院）报销比例80%，限额200元；一级医院报销比例60%，限额300元；二级医疗机构报销比例50%，限额400元；三级医疗机构报销比例40%，限额500元。
- “慢特病”报销 ：
- 一档和二档的慢性病和特病报销比例和种类有所不同，具体可参考相关政策文件。
- 就医原则 ：
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一档参保人可以在市内任一定点医疗机构就医。
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二档参保人门诊在选定社康中心就医，经结算医院同意，可在与选定社康中心同属于一家医疗集团网格内定点医疗机构之间转诊。
- 其他待遇 ：
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一档年度最高报销限额为8万元，二档最高报销限额为12万元。
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门诊报销年报销限额：一档300元，二档500元。
综上所述，重庆农村医保一档和二档在缴费标准、住院报销比例、普通门诊报销、慢性病和特病报销、就医原则等方面存在明显差异。建议根据自身经济状况和需求选择合适的医保档次。
