灵活就业医保和新农合的主要区别体现在以下几个方面：
- 针对对象不同 ：
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新农合 ：针对的是农民，由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。
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灵活就业医保 ：主要针对的是未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员，以及其他就业人员和个体工商户等。
- 缴费方式不同 ：
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新农合 ：一年缴费一次，由个人缴费。
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灵活就业医保 ：按月缴费，有单位由单位承担统筹部分，灵活就业个人要承担部分统筹缴费。
- 报销比例和范围不同 ：
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新农合 ：报销比例相对较低，在一些地区仅为60%~70%左右，特殊医疗服务可能不在报销范围之内。
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灵活就业医保 ：报销比例通常在90%以上，报销范围更广，甚至可以覆盖一些高端医疗服务。
- 使用范围不同 ：
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新农合 ：目前多个城市只有住院才能报销，少部分城市看病就诊也可以报销。
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灵活就业医保 ：可以用于挂号、看病就医、药店买药、住院治疗报销等。
- 其他待遇不同 ：
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灵活就业医保 ：有个人账户，个人账户里的钱可以在定点的药店购买相关的药品或医疗器材，累计缴满25年之后还可以终身享受医保待遇。
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新农合 ：没有个人账户，需要一直缴费，没有退休政策，终身需要缴费。
建议
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经济情况较好 ：建议选择灵活就业医保，因为其报销比例高，报销范围广，且有个人账户和终身医保待遇。
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经济情况一般 ：可以根据就医地点选择新农合或灵活就业医保。如果在乡镇医院治疗，新农合的报销比例较高；如果在市级以上医院，灵活就业医保的报销比例较高。
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经济情况较差 ：新农合是一个经济实惠的选择，虽然报销比例较低，但缴费少，适合经济条件有限的人群。
