病假超过三个月的规定主要涉及医疗期的确定、病假工资的发放以及相关法律法规对特殊情况的处理。以下是具体规定：
一、医疗期的确定
根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。医疗期的长短根据职工的实际工作年限和在本单位的工作年限来确定：
实际工作年限十年以下：
在本单位工作年限五年以下的，医疗期为三个月；
在本单位工作年限五年以上的，医疗期为六个月。
实际工作年限十年以上：
在本单位工作年限五年以下的，医疗期为六个月；
在本单位工作年限五年以上十年以下的，医疗期为九个月；
在本单位工作年限十年以上十五年以下的，医疗期为十二个月；
在本单位工作年限十五年以上二十年以下的，医疗期为十八个月；
在本单位工作年限二十年以上的，医疗期为二十四个月。
二、病假工资的发放
医疗期内：
停工治疗在6个月以内：企业应按以下标准支付疾病休假工资：
连续工龄不满2年的，按本人工资的60%计发；
连续工龄满2年不满4年的，按本人工资的70%计发；
连续工龄满4年不满6年的，按本人工资的80%计发；
连续工龄满6年不满8年的，按本人工资的90%计发；
连续工龄满8年及以上的，按本人工资的100%计发。
停工治疗超过6个月：企业应支付疾病救济费：
连续工龄不满1年的，按本人工资的40%计发；
连续工龄满1年不满3年的，按本人工资的50%计发；
连续工龄满3年及以上的，按本人工资的60%计发。
三、相关法律法规
《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》：明确了医疗期的计算方法和病假工资的发放标准。
《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》：规定了职工患病或非因工负伤治疗期间的病假工资或疾病救济费支付标准，不得低于当地最低工资标准的80%。
《职工带薪年休假条例》：规定了职工请病假累计时间超过一定期限的，不享受当年的年休假。
四、特殊情况
特殊疾病：对于某些患特殊疾病（如癌症、精神病、瘫痪等）的职工，在24个月内尚不能痊愈的，经企业和劳动主管部门批准，可以适当延长医疗期。
医疗期满后的处理：病假超过规定医疗期的，需重新评定岗位级别，医疗期后按照国家相关规定执行。经县以上劳动鉴定委员会鉴定，属于完全丧失劳动能力的，应按有关规定作退休、退职或一次性处理；属于大部分或者部分丧失劳动能力的，医疗期满后，企业可以解除劳动合同，并按有关规定支付经济补偿金和医疗补助费。
这些规定旨在保障职工在患病或非因工负伤期间的合法权益，同时确保企业的正常运营。