农村合作医疗（新农合）每年交的钱会清零，这是因为新型农村合作医疗是 每年缴纳，当年的保险只适用于当年的医保报销 。因此，没有必要补交，但是第二年的合作医疗要记得提前缴纳，因为有等待期。

具体来说，新农合的缴费机制为当年缴费，次年的1月1日才生效，次年可以进行医疗报销。这意味着，新农合的资金是每年重新筹集的，上一年度的资金在当年年底进行结算后，如果未使用完，则会被清零。

这种每年清零的机制有其特定的原因和目的。首先，新农合的重点在于大病统筹，即集中资金为农民解决因患重大疾病而产生的高额医疗费用。如果资金可以累计，可能会导致部分农民在小病时过度使用医保资金，而在大病时却出现资金不足的情况。因此，一年一清零的方式可以确保每年的资金都能集中用于大病患者的救治，提高资金的使用效率。

其次，新农合的资金主要来源于农民个人缴费、集体扶持和政府补助，其资金规模和稳定性相对较弱。如果资金可以累计，可能会对基金的稳定运行造成不利影响。因此，每年清零有助于保持资金的稳定和可持续性。

综上所述，农村合作医疗每年清零是因为每年的保险只适用于当年的医保报销，资金每年重新筹集和分配，以确保大病统筹的资金需求。这种机制有助于提高资金使用效率，保障农民在患大病时能够得到及时有效的医疗救治。