合作医疗（新型农村合作医疗保险）交了但医院查不到，可能的原因有以下几点：

1. 医保系统升级或故障 ：医保系统可能正在进行升级或维护，导致暂时无法查询到缴费信息。

2. 信息录入延迟 ：缴纳医疗保险后，信息需要一定时间录入系统，可能会出现延迟。

3. 信息录入错误 ：在录入医疗保险信息时可能会出现姓名、身份证号等个人信息错误，导致查询不到。

4. 缺乏个人账户 ：城乡居民医保和新农合没有医保个人账户，因此无法查询到缴费记录。

5. 网络更新延迟 ：网络更新信息存在延迟，需要多次刷新网络才能看到最新的缴费信息。

6. 地区查询限制 ：所在地区可能暂时无法查询个人医保账户，建议联系当地医保局了解相关政策和规定。

7. 注册名称不符 ：职工医保的注册姓名与当地医保局姓名不符，建议参保人核查个人注册姓名是否正确。

8. 信息未及时更新 ：缴费后，相关信息可能没有被及时更新到系统中。

9. 查询方式不当 ：可能是查询的网站或者方法不正确，导致查不到信息。

10. 系统故障 ：医疗保险信息系统可能因故障导致暂时无法查询。

11. 第一次缴费未录入信息 ：如果是第一次在网上操作缴费，需要个人去户籍所在地的办理处录入个人信息，然后再缴费。

12. 个人信息未联网 ：个人信息可能未联网，导致在网上查不到缴费信息。

建议采取以下措施：

• 耐心等待 ：如果是系统升级或信息录入延迟，可以耐心等待一段时间后再查询。

• 检查信息 ：核查个人信息是否录入正确，包括姓名、身份证号等。

• 刷新网络 ：多次刷新网络，查看是否有最新的缴费信息更新。

• 联系当地医保局 ：如果以上方法都无法解决问题，建议联系当地医保局了解具体原因和解决方案。

• 提供证明 ：如果确认已缴费但无法查询，可以提供相关证明，如村委会开具的证明，到当地县级新农合管理部门进行查询。

希望这些信息能帮助你解决问题。