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社保停缴后是可以交农村合作医疗的。具体操作步骤如下：
- 社保转新农合 ：
- 社保停缴后，可以转为缴纳农村合作医疗。社保转新农合属于高转低，即当月缴纳新农合费用次月享受新农合待遇，以后缴费是一年一度，终身缴费。
- 缴费时间 ：
- 农村合作医疗的保障期间为一年，缴费时间统一为前一年度的10月到12月份。如果中间断交了，到下一个缴费时间继续购买即可。
- 销户和重新参保 ：
- 如果社保停缴后想交新农合，可以先进行社保销户手续，再办理新农合参保登记手续。需要携带身份证原件和复印件、员工离职证明等证件资料，前往医保经办机构办理销户手续，再携带身份证、户口簿原件及复印件以及近期的免冠照片等材料，前往户籍所在地的村委会或居委会办理参保登记手续。
- 避免重复参保 ：
- 社保和新农合（城乡居民基本医疗保险）不能重复报销，也不能重复投保。如果已经有了职工医保账户，新农合是无法缴纳的。
- 参保登记 ：
- 新农合的参保登记可以通过支付宝等线上平台办理，或者到户口所在地的乡镇、街道办理居民基本医疗保险的参保登记，登记完成后在税务部门进行缴费。
综上所述，社保停缴后是可以交农村合作医疗的，只需按照上述步骤进行操作即可。建议先确认自己的社保状态，然后选择合适的参保方式，确保医疗保障的连续性。