医保和农村合作医疗的主要区别如下：
- 参保对象 ：
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农村合作医疗 （简称新农合）主要针对农村户口的居民，且必须以家庭为单位整户参加。
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医保 （城镇职工基本医疗保险）则覆盖城镇所有单位和职工，不限户籍。
- 缴费方式 ：
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新农合 由农民个人每年自愿缴费，缴费标准较低，且不能采取个人缴费、集体扶持和政府资助相结合的方式筹集资金。
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医保 由用人单位和职工共同缴纳，用人单位缴费率控制在职工工资总额的6%左右，职工缴费率一般为本人工资收入的2%。
- 保障力度和待遇 ：
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新农合 的保障水平相对较低，主要关注大病统筹，小病治疗费用需农民自行承担，报销比例较低。
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医保 的保障水平较高，覆盖范围广泛，包括基本医疗费用、住院费用、门诊费用等，且在大病保障方面相对较好，报销比例较高。
- 缴费频率和期限 ：
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新农合 一年缴费一次，交一年保一年。
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医保 按月缴费，由单位和个人共同承担，参保人员完成缴费年限后可以终身享受医保待遇。
- 包含项目 ：
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新农合 只包含医疗保险。
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医保 包含医疗保险、养老保险、失业保险、工伤保险和生育保险，即五险。
综上所述，医保和农村合作医疗在参保对象、缴费方式、保障力度和待遇、缴费频率和期限以及包含项目等方面存在明显的差异。建议根据自身情况选择合适的医疗保障方式，以确保获得充分的医疗保障。