公司的医疗保险和合作医疗 不一样 ，它们有以下主要区别：
- 覆盖对象不同 ：
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医疗保险 ：通常是指职工医保或城镇居民医保，覆盖具有非农业户口的城镇居民以及用人单位和个人缴费建立的医疗保险基金。
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合作医疗 ：主要针对农村户口的人群，以家庭为单位整户参加，资金由三方出资（政府补贴、村集体扶持以及个人缴费）。
- 系统管理不同 ：
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医疗保险 ：属于社保系统管理，城镇职工基本医疗保险费由职工和公司共同承担。
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合作医疗 ：由卫生局的业务管理，不可以异地交付。
- 筹资水平不同 ：
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医疗保险 ：筹资水平较高，报销比例也相对较高。
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合作医疗 ：筹资水平较低，报销比例相对较低。
- 缴费方式不同 ：
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医疗保险 ：由职工和公司共同承担费用，职工医保每个月都需要缴费，并且会有个人账户和统筹账户。
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合作医疗 ：由参保人负担全部费用，农民自愿参加。
- 待遇不同 ：
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医疗保险 ：参保人除了享受个人账户费用门诊包干，还可以享受住院医疗，报销比例和额度较高。
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合作医疗 ：费用补助，报销范围较窄。
综上所述，公司的医疗保险和合作医疗在覆盖对象、系统管理、筹资水平、缴费方式以及待遇等方面都存在明显的区别。建议根据自身情况选择合适的医疗保险类型进行参保。