城镇居民医疗和新农合的主要区别体现在以下几个方面：
- 参保对象 ：
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新农合 ：主要面向具有农村户籍的居民，是农民自愿参加的、以大病统筹为主的医疗互助共济制度，要求农民以家庭为单位整户参加。
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城镇居民医保 ：主要覆盖具有城镇户籍的城镇非从业人员，包括在城区学校就读的在校学生等，不受户籍限制，均可参加。
- 报销比例 ：
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新农合 ：在三甲医院的报销比例相对较低，可能只有30%左右，但在乡镇医院的报销比例较高。
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城镇居民医保 ：在三甲医院的报销比例一般较高，可达到50%左右，通过逐级转院的方式，报销比例甚至可达到70%。
- 政府补助 ：
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新农合 ：政府补助普遍高于城镇居民医保，政府每年每人补助资金平均在400到500元左右。
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城镇居民医保 ：政府补助相对较少，具体数额因地区政策而异。
- 管理部门 ：
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新农合 ：多数地方由卫生部门进行管理。
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城镇居民医保 ：主要由人力资源和社会保障部门负责管理和运作。
- 参保方式 ：
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新农合 ：在农村实行按户缴纳的方式。
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城镇居民医保 ：实行按人来缴纳。
- 保障待遇 ：
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新农合 ：主要侧重于大病统筹，旨在为农民在面对重大疾病时提供经济保障。
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城镇居民医保 ：保障待遇主要侧重于住院和门诊大病，同时兼顾普通门诊。
- 整合情况 ：
- 近几年，国家开始倡导新农合和城镇居民医疗统一并轨，统称为“城乡居民基本医疗保险”。2020年开始，绝大数地区已经实现了“新农合”与“城镇居民医保”的合并，看病不再区分城市和农村。
综上所述，虽然新农合和城镇居民医保在参保对象、报销比例、政府补助、管理部门等方面存在明显区别，但国家正在推动两者整合，逐步实现统一的医疗保障制度，以更好地保障城乡居民的医疗需求。