新农合医疗保险（新型农村合作医疗）和农村医保（通常指城镇居民基本医疗保险）之间存在以下主要区别：
- 参保对象 ：
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新农合 ：主要针对农村户口居民，必须是农村户口才能参加。
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农村医保 ：通常指的是没有参加城镇职工医疗保险的城镇居民。
- 缴费方式和期限 ：
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新农合 ：一年缴纳一次费用，由个人缴费和政府补贴组成。
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农村医保 ：一般按月缴纳费用，有单位由单位承担统筹部分，灵活就业人员个人要承担部分统筹缴费。
- 保险期限和待遇 ：
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新农合 ：缴费一次可以获得一年的保险，因基金筹措有限，保障力度相对较低。
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农村医保 ：累计缴费年限满足要求后，可以终身享受医保待遇。
- 报销比例和范围 ：
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新农合 ：报销比例较低，通常在50%-70%之间，且异地报销可能更低。报销范围主要包括住院医疗费，且起付线较低。
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农村医保 ：报销比例较高，通常在70%-90%之间，包括门诊、住院和买药等医疗费用。起付线较高。
- 政府补助 ：
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新农合 ：政府补助普遍高于城镇居民医保，平均每人每年补助资金在400到500元左右。
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农村医保 ：政府补助力度相对较小，具体金额因地区和政策而异。
- 包含项目 ：
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新农合 ：只包含医疗保险。
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农村医保 ：通常包含医疗保险、养老保险、失业保险、工伤保险和生育保险（五险）。
- 管理和政策 ：
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新农合 ：由卫生部门管理，以大病统筹为主，小病由农民自己承担。
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农村医保 ：由社保部门管理，具有“低水平，广覆盖”的特点，缴费以低水平的绝大多数单位和个人能承受的费用为准。
总的来说，新农合医疗保险主要针对农村居民，缴费较低，保障力度相对较低，而农村医保（城镇居民基本医疗保险）主要针对城镇居民，缴费较高，保障力度和报销比例较高。两者在参保对象、缴费方式、保险期限、报销比例、政府补助等方面存在明显差异。
