四川大学华西医院目前共有四个院区，分别是本部院区、温江院区、郫都院区和天府新区医院。
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本部院区 ：位于四川省成都市武侯区国学巷37号，始建于1892年，是医院的核心院区，集中了医院的主要医疗资源，包括医疗、教学、科研、预防、保健等功能。
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温江院区 ：位于成都市温江区永宁街道芙蓉大道三段363号，是华西医院的直属分院，主要提供门诊服务，部分检查也可以在本部取报告。
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郫都院区 ：位于成都市郫都区高新西区尚锦路255号，也是华西医院的直属分院，提供门诊和住院服务。
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天府新区医院 ：位于成都市双流区天府新区天府大道南二段3966号，是华西医院与天府新区合作建设的医院，提供全面的医疗服务，包括门诊、住院、手术等。
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锦江院区 ：位于成都市锦江区锦江大道1166号，是华西医院的新建院区，于2025年2月5日全面试运行。锦江院区将承担国家紧急医学救援基地、创伤医学中心、神经疾病中心、感染性疾病中心等重要功能，设置有神经疾病中心、儿童医学中心、感染性疾病中心等五大专病中心。
这些院区之间存在一定距离，患者在挂号和就诊时需要仔细看清就诊地点，以免跑错院区。同时，各院区实行同质化管理，出诊医生安排综合考虑患者需求以及各专业配套支撑性进行设置，确保医疗服务的质量和效率。