新农合在三甲医院门诊的报销比例一般为 20%-30% 。具体报销比例可能因地区和政策的不同而有所差异。以下是一些可能影响报销比例的因素：

1. 医院级别 ：定点医疗机构的级别不同，报销比例也有所不同。三级医院的报销比例通常较低，而一级医疗机构的报销比例较高。

2. 就诊类型 ：普通门诊的报销比例相对较低，而对于一些慢性病门诊，如高血压、糖尿病等，符合规定的费用也能按一定比例报销。

3. 医保目录 ：如果患者使用了大量医保目录外的自费药品和诊疗项目，实际报销的金额可能会降低。

4. 转诊证明 ：如果患者需要从村卫生室或乡镇卫生院转诊到三级医院，需要提前办理转诊证明，否则报销比例可能会降低。

5. 跨市就医 ：如果患者需要跨市就医，需要在参保地备案，报销比例可能会降低10%-15%。

6. 急诊情况 ：在急诊情况下，患者可以保留急诊诊断证明，并在3个月内补办备案手续，以确保报销。

新农合在三甲医院门诊的报销比例一般为20%-30%，但具体报销比例还需根据患者的具体情况和当地政策来确定。建议患者在就诊前咨询当地医保部门或医院，了解详细的报销政策和比例。