办了特殊门诊后住院的报销比例主要取决于以下因素：
参保类型
城镇职工医保：一般来说，住院费用报销比例较高，通常在85%以上，部分地区对重大疾病住院费用报销比例可达95%。
城乡居民医保：住院费用报销比例相对较低，一般在70%左右。
医疗机构级别
一级医疗机构：报销比例通常较高，如城乡居民医保在一级医疗机构住院报销比例可达90%。
二级医疗机构：报销比例一般在80%左右，如北京市在职职工在二级医疗机构住院报销比例为85%以上。
三级医疗机构：报销比例相对较低，一般在70%-80%之间，如北京市在职职工在三级医疗机构住院报销比例为85%以上。
疾病类型
重大疾病：如癌症、尿毒症等，部分地区对重大疾病住院费用报销比例可达95%，甚至实行全额报销。
特殊疾病：如慢性病、罕见病等，报销比例通常在80%-90%之间。
地区政策
不同地区的医保政策存在差异，具体报销比例需要根据当地医保部门的规定执行。例如：
北京市：在职职工住院报销比例在85%以上，退休人员住院报销比例在90%以上，最高可达99.1%，住院封顶线为50万元。
广西壮族自治区：居民医保在一级、二级、三级定点医疗机构住院的，居民医保基金支付比例分别为90%、75%、60%。
综上所述，办了特殊门诊后住院的报销比例因参保类型、医疗机构级别、疾病类型和地区政策而有所不同。建议您咨询当地的医保部门或医疗机构，了解具体的报销政策和比例。
