上海交通大学医学院附属第九医院（简称九院）南院和北院的区别主要体现在以下几个方面：
- 地点和规格 ：
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南院 ：即总部，位于上海市黄浦区制造局路639号，是最初的旧校区，专家和医生较多，总核定床位数为1000张。
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北院 ：位于上海市宝山漠河路280号（原市三医院），是后来建立的新校区，建筑、周围环境和基础设施比南院好，总核定床位数为800张。
- 环境和设施 ：
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北院 ：新盖的住院楼，环境相对较好。
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南院 ：最初的老校区，设施相对较旧，但仍然是上海市重要的综合性医院之一。
- 医疗水平和专家资源 ：
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南院 ：专家资源较为丰富，许多知名专家都在南院。
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北院 ：医疗水平与南院相当，专家每周互相交换坐诊，因此没有明显的优劣之分。
- 科室特色 ：
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南院 ：以口腔科和整形外科闻名，这两个科室在国内处于领先地位。
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北院 ：较为综合性，涵盖了多个科室，可以满足不同患者的需求。
- 交通情况 ：
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南院 ：位于上海市中心，交通便利，通过地铁、公交和驾车都很方便。
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北院 ：位于上海的北翼，距离南院约25公里，根据交通状况需30分钟至1小时的车程。
建议
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选择院区 ：如果主要关注口腔科和整形外科，南院是更好的选择。如果希望有更好的环境和设施，且地理位置相对方便，北院也是一个不错的选择。
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预约专家 ：由于南院的专家资源较为丰富，建议提前预约以确保能够看上有名的专家。
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交通安排 ：根据居住地选择最近的院区，以节省时间和交通成本。