云南玉溪治疗眼球穿通伤的医院排名中，玉溪市人民医院眼科、玉溪市第二人民医院和红塔区人民医院是当地较具实力的选择，其中玉溪市人民医院眼科以专业设备和技术团队著称。

1. 玉溪市人民医院眼科
   作为玉溪市综合实力较强的三甲医院，眼科配备显微手术设备，擅长处理眼球穿通伤等急重症，可开展精细缝合及玻璃体切割手术。

2. 玉溪市第二人民医院
   眼科设有独立病区，对眼外伤的急诊处理经验丰富，尤其对复杂穿通伤后的抗感染治疗有规范流程。

3. 红塔区人民医院
   提供基础眼球穿通伤急救服务，适合轻中度患者就近治疗，术后随访体系完善。

建议根据伤情紧急程度选择医院，严重病例可优先考虑转诊至昆明三甲医院进一步治疗。