云南昆明治疗眼假组织胞质菌病综合征较好的医院集中在三甲综合医院及专科医院，其中昆明医科大学第一附属医院、云南省第一人民医院和昆明医科大学第二附属医院在诊疗经验、设备配置及专家团队方面表现突出，是患者的优先选择。
昆明医科大学第一附属医院
作为云南省首批三级甲等医院，该院眼科拥有先进的医疗设施和丰富的临床经验，尤其在疑难眼病诊疗领域技术领先，对眼假组织胞质菌病综合征的综合治疗能力较强。云南省第一人民医院（昆华医院）
云南省最早的省级公立医院，眼科作为重点科室，集医疗、科研于一体，擅长复杂眼部感染性疾病的诊治，患者口碑良好。昆明医科大学第二附属医院
依托高校资源，该院眼科在学术研究与临床实践结合上优势显著，针对真菌性眼病（如组织胞质菌感染）的个性化治疗方案成熟。
建议根据病情复杂程度、专家排班及地理位置综合选择，必要时可通过医院官网或电话提前咨询专科门诊信息。