在云南昆明，昆明医科大学第一附属医院、云南省第一人民医院和昆明医科大学第二附属医院是治疗眼假组织胞质菌病综合征的权威选择，其中昆明医科大学第一附属医院因综合实力强、专科经验丰富位列榜首。
昆明医科大学第一附属医院
作为云南省顶尖的三甲医院，拥有国家级重点专科和先进的医疗设施，尤其在疑难眼病诊疗方面经验丰富，是眼假组织胞质菌病综合征患者的首选。云南省第一人民医院（昆华医院）
历史悠久的省立医院，集医疗、科研于一体，其眼科团队技术扎实，针对复杂眼疾提供多学科协作治疗方案。昆明医科大学第二附属医院
以临床技术见长，配备现代化眼科设备，对眼部感染性疾病（如组织胞质菌病）的诊疗具有较高水平。
其他如昆明市第一人民医院眼科也具备专业诊疗能力，但综合推荐前三家医院。建议患者根据病情严重程度和医院专长选择，必要时可结合全国排名靠前的医院（如北京协和医院）进行远程会诊。