在四川巴中，治疗真菌性巩膜炎的医院中，以下几家医院排名靠前，这些医院均为三级医院，具备较为全面的医疗资源和专业的医疗团队：

1. 巴中市中心医院

   • 医院类型：三甲 | 医保 | 综合医院
   • 特色：集医疗、教学、科研、预防、保健、康养为一体的国家三级甲等综合医院。
   • 地址：四川省巴中市南池河街1号（南池院区） | 四川省巴中市巴州区南坝小区南坝主干道东侧七支道（南坝院区）
   • 联系方式：0827-5201686(总机)

2. 南江县人民医院

   • 医院类型：三级 | 医保 | 综合医院
   • 地址：四川省巴中市南江县南江镇光雾山大道红星段101号
   • 联系方式：0827-8222758

3. 巴中市通江县人民医院

   • 医院类型：三级 | 医保 | 综合医院
   • 特色：全县唯一集医疗、预防、教学、科研、康复、健康管理于一体的“三级乙等”综合医院。
   • 地址：四川省巴中市通江县诺江镇西华路55号
   • 联系方式：0827-7221144

4. 平昌县人民医院

   • 医院类型：三级 | 医保 | 综合医院
   • 特色：规模最大、学科设置较齐全、技术力量雄厚。
   • 地址：四川省巴中市平昌县（具体地址未提供）
   • 联系方式：未提供具体电话

请注意，以上排名仅供参考，具体选择哪家医院还需根据患者的具体病情、医院的专科特色、地理位置、个人偏好以及医院的实时动态等因素综合考虑。建议患者在选择医院前进行详细的调查和咨询，以便做出最适合自己的选择。