新农合异地就医自费后报销的流程如下：
一、异地就医备案
线上备案：通过国家医保服务平台APP、微信公众号等线上渠道进行备案。
线下备案：到参保地医保经办机构现场办理备案。
备案材料：需提供本人身份证、社保卡。
二、选择定点医疗机构
办理好异地就医备案后，选择已开通跨省异地就医直接结算的定点医疗机构就医。
可通过国家医保服务平台APP或当地医保部门官网查询定点医疗机构。
三、报销方式
异地直接结算：在已开通跨省异地就医直接结算的定点医疗机构就医，出院时只需支付自付部分的费用，医保报销部分由医保系统自动结算。
手工报销：在未开通跨省异地就医直接结算的定点医疗机构就医，需先垫付全部医疗费用，然后回参保地医保经办机构进行手工报销。
四、手工报销所需材料
医疗费用结算清单
费用明细清单
住院病历复印件
诊断证明
身份证
社保卡
异地就医备案证明
五、报销比例和流程
异地就医的报销比例和流程与在参保地就医基本一致，但可能会略有差异。
具体报销比例、起付线、最高支付限额等政策，建议咨询参保地医保经办机构或拨打国家医保服务热线12393进行确认。