伊犁州友谊医院、伊犁哈萨克自治州新华医院、伊犁哈萨克自治州中医医院。这些医院在综合实力、专科诊疗和援疆专家支持下，具备较强的治疗周期性动眼神经麻痹的能力，是新疆伊犁地区治疗此类疾病的首选医院。

一、伊犁州友谊医院

1. 综合实力：三级甲等综合医院，集医疗、科研、教学于一体，是新疆医科大学的教学医院。
2. 专科优势：擅长重症医学、心血管疾病等疑难病症的诊疗。
3. 援疆支持：依托江苏省人民医院的“邵永丰名医工作室”，引入先进医疗技术和团队支持，尤其在复杂手术和高难度病例处理方面具有优势。

二、伊犁哈萨克自治州新华医院

1. 综合实力：三级甲等综合医院，自治区重点建设医院。
2. 专科优势：在心血管疾病、重症医学等领域表现突出，医疗设备先进。
3. 技术特点：具备开展复杂手术的能力，是区域内重要的医疗中心。

三、伊犁哈萨克自治州中医医院

1. 综合实力：三级甲等中医医院，以中医特色诊疗和康复服务见长。
2. 专科优势：拥有多个自治区临床重点专科，如眼科、肾病科等。
3. 中医特色：结合中医和现代医学治疗手段，为患者提供多样化的治疗方案。

表格对比：伊犁主要医院治疗周期性动眼神经麻痹能力

总结

新疆伊犁地区在治疗周期性动眼神经麻痹方面，伊犁州友谊医院凭借其综合实力和援疆专家支持，在复杂病例处理和先进技术引入方面具有明显优势；新华医院和中医医院则在心血管疾病和中医特色诊疗领域表现突出，为患者提供了多样化的治疗选择。根据自身需求和病情特点，患者可以选择合适的医院进行治疗。